KREX® 蛋白折叠技术
利用自身抗体区分患者群体
分析自身抗体谱能够更全面地揭示患者的免疫状态,为疾病的评估和治疗效果的预测带来了巨大希望。经过Sengenics蛋白质阵列验证的自身抗体生物标志物,已经在早期疾病检测、患者分类、疗效预测以及伴随诊断技术的开发中展现出了其重要的应用价值。
10x Genomics单细胞技术优势
研究案例
※ 55微升样本
※ 检测7288个蛋白
※ 样本类型涵盖血液,尿液,体液
※ 样本来源包含人及其它模式动物
※ 10log动态范围可以检测极低丰度蛋白
※ 参与了全球主要人群和疾病模型的队列项目
※ 液体活检,肿瘤早筛,肿瘤标志物发现
※ 药物开发,伴随诊断,药物适应症拓展
※ 已发表CNS,JAMA,Lancert等高分文献近千篇
※ 已与全球数十家头部药企开展合作
心血管疾病
循环蛋白是心血管疾病的重要指标。 SomaScan获得的数据在超过55篇心血管疾病相关文献中得到了应用。
糖尿病
使用SomaScan获得的数据建立的模型已被用于预测从糖尿病前期到糖尿病的进展。
肿瘤学和免疫疗法
通过测量循环蛋白,识别和表征癌症并预测对免疫疗法的反应。
非酒精性脂肪肝
SomaScan可用于检测非酒精性脂肪肝病相关的生物标志物。
罕见病
SomaScan已被用于生物标志物发现和通路分析,以帮助诊断和开发罕见病的有效治疗方法。
神经学 SomaScan能够同时对7000种蛋白质进行分析,非常适合在少量血液或脑脊液中测量低丰度和高丰度的蛋白质。
somalogic提供定制化和针对特定疾病的panel,以实现更有针对性的蛋白质分析。
鉴定生物标志物和生物标志物通路可用于:
药物研发
• 靶点鉴定 • 靶点验证 • 作用机制 • 药物动力学/药效学 • 临床试验的富集 • 临床试验的分层
学术研究
• 疾病生物学建模 • 疾病亚表型研究 • 生理学调查 • 通路调节研究 • 实验室到临床的快速转化 • 与临床治疗相协调
我们可以为您提供SomaScan 检测服务,如您有相关需求,欢迎与我们取得联系!
服务产品
*本服务仅限科研使用,不可用于临床诊断流程
非小细胞肺癌中预测性自身抗体生物标志物组合
Kaplan-Meier显示了接受肺切除术的非小细胞肺癌(NSCLC)患者中,高表达和低表达13种自身抗体生物标志物组合的患者的总体生存率。高表达该组合的患者生存率较低,5年总生存率仅为7.6%。
类风湿关节炎患者中抗药抗体的候选自身抗体生物标志物
候选自身抗体生物标志物用于预测阿达木单抗治疗的类风湿关节炎患者中抗药抗体(ADAb)的产生。热图展示了自身抗体的存在情况,以及根据抗药抗体的存在与否和临床疗效进行的层次聚类。血浆样本分别在基线时和阿达木单抗治疗 24周后采集。自身抗体水平以相对荧光单位(RFU)测量,并用颜色标度表示。
系统性红斑狼疮患者的分层
来自发现队列(n=186)和验证队列(n=91)的79种已验证自身抗体的无监督层次聚类热图。这些自身抗体被聚类为四个不同的组。这些聚类可能代表了系统性红斑狼疮(SLE)的不同分子亚型,这些亚型具有不同的疾病发展轨迹和对治疗的不同反应。
Sengenics提供服务和产品,助力您识别和验证自身抗体特征,以推进您的生物标志物研究项目。我们的专家将与您携手合作,优化研究效能和设计,并为每个服务项目提供经验丰富的生物信息学分析。
自身抗体谱分析:发现和验证自身抗体生物标志物特征谱
肿瘤学药物筛选: 快速高效地筛选免疫肿瘤学药物靶点
系统血清学: 深入探索体液免疫反应
疫苗开发: 进行抗体谱分析,为疫苗开发提供支持
定制阵列: 灵活的形式用于高通量筛选
KREX 蛋白折叠技术
我们的专利KREX®蛋白质折叠技术能够表达功能性蛋白质,并据此构建高密度蛋白阵列,极大地加速了自身抗体生物标志物的发现进程。该技术提供了一种简便快捷的方法,用于固定和纯化正确折叠的蛋白质,从而有效检测自身抗体。
它是如何工作的?
• KREX技术确保仅将正确折叠的蛋白质固定在阵列表面。
• 阻止错误折叠的蛋白质附着,并将其洗去。
• 被固定的蛋白质能够保持其折叠结构,在水凝胶涂层的阵列表面上展现出与在自由溶液中相似的行为。
• 这保证了每个检测都使用正确折叠、全长且功能性的蛋白质进行,这对于自身抗体检测来说至关重要。因为超过90%的抗体识别的是构象表位,而这些表位仅在蛋白质正确折叠时才存在。
借助独有的表面化学技术,固定的蛋白质能够展现出与在自由溶液中相似的行为特性。
• 蛋白质被固定到涂有链霉亲和素的水凝胶层上。
• 在水性环境中,蛋白质能够保持其折叠结构和功能特性。
• 蛋白质从玻璃表面伸出,并在单一位点附着,从而确保在每个阵列上都能保持一致的定向排列。
在正确折叠、全长且功能性的蛋白质上进行检测,才能获得具有生物学意义的准确结果。蛋白质的功能发挥,离不开其特定的三维结构。无论是药物与蛋白质的结合、蛋白质之间的相互作用,还是蛋白质与配体的相互作用,都要求蛋白质保持正确的折叠结构。这一点对于基于自身抗体的检测尤为重要,因为抗体与抗原之间的相互作用具有极高的特异性。抗体通常识别的是蛋白质表面不连续的三维构象和电荷分布,而非特定的线性肽段序列。如果蛋白质未能正确折叠,那么剩余的线性序列可能并不构成具有生物学相关性的表位。只有蛋白质正确折叠时,才能呈现出那些为抗体识别提供生理选择性和特异性的不连续表位。
技术性能
卓越的一致性
Sengenics KREX®蛋白质折叠技术能够创建出具有高度一致性的蛋白质阵列。上图展示了Sengenicsi-Ome®蛋白质阵列与市面上另一款蛋白质阵列(Protein Array PX)在蛋白质内重复样本变异系数百分比(CV%)上的对比,i-Ome® 的平均CV%仅为7.2%,而Protein Array PX的CV%则高达37%。
高度再现性
Sengenics蛋白质阵列通过设置多个阳性和阴性对照,来确保同一研究内部以及不同研究和批次之间的数据重复性。上图展示了两个不同批次中6524个蛋白质数据点的自身抗体水平比较结果,其皮尔逊相关系数高达0.97以上,几乎达到完美相关。
高度特异性
Sengenics蛋白质阵列通过确保蛋白质的正确折叠,使得构象表位能够暴露出来,与自身抗体结合(90%的抗体表位都是非线性的)。因此,与其他信噪比较低的阵列相比,我们的阵列能够产生更特定的阳性结果,同时背景噪声也更低。
皮摩尔的敏感度
Sengenics蛋白质阵列能够以极高的灵敏度检测自身抗体,仅需1-10µl的血清样本。其检测限低至10pg/ml),并且线性动态范围至少覆盖5个数量级。
应对普遍存在的挑战
超过90%的抗体表位是构象性的;抗体识别的是表位的形状,而非其氨基酸序列。传统阵列平台使用蛋白质片段、错误折叠或变性的蛋白质。这些肽段和蛋白质片段缺少构象表位,并且常常暴露出疏水表面,导致非特异性抗体的结合,这会产生非特异性阳性结果,且信噪比低。而Sengenics阵列则采用了我们专利的KREX®蛋白质折叠技术,展示的是全长、正确折叠的蛋白质。这样,构象表位得以完整保留,从而产生了高度特异的阳性结果,背景噪声极低,且实验结果具有高度可重复性。
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