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经典应用案例

  • Nat Commun.| 清华大学携手协和医学院肿瘤医院应用单细胞转录组测序联合多重荧光免疫组化技术发现胃癌中T细胞耗竭新路径

    清华大学蓝勋团队与中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院胰胃外科田艳涛团队合作,于去年8月在《Nature Communications》上发表的题为“scRNA-seq of gastric tumor shows complex intercellular interaction with an alternative T cell exhaustion trajectory”的研究成果,通过应用单细胞转录组测序(sc-RNASeq)结合PhenoImager多重荧光免疫组化技术(mIHC),绘制了胃癌患者肿瘤组织、癌旁正常组织和匹配的外周血中免疫细胞、基质细胞和上皮细胞的表达图谱,并结合T细胞受体(TCR/BCR)进行全谱分析。该研究发现了胃癌肿瘤微环境中新的T细胞耗竭路径,并预测其作为胃癌靶向治疗靶点的可能。

    26 2023-05-30
  • Sci Adv | PhenoCycler 52个超多蛋白靶标建立溃疡性肠炎空间图谱,发现预测患者治疗响应性指标

    溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)研究领域又有新进展!近日,斯坦福医学院的Stephan Rogalla研究团队在《Science Advances》(IF=14.957)杂志上发表了题为“溃疡性结肠炎组织图谱揭示疾病驱动的炎症细胞类型及其对 TNF 抑制剂治疗耐药性的性别差异(A tissue atlas of ulcerative colitis revealing evidence of sex-dependent differences in disease-driving inflammatory cell types and resistance to TNF inhibitor therapy )”的文章,作者通过对UC患者临床活检样本的52个蛋白标志物成像+空间邻域分析,建立了UC组织微环境的空间图谱并总结了TNF抑制剂治疗导致炎症细胞邻域变化的规律,进而给出通过空间蛋白组学方法进行UC患者治疗响应程度预测的建议方案[1]。

    27 2023-05-30